Και η Εκκλησία της Κρήτης φαίνεται να αιφνιδιάστηκε από τις εξελίξεις, αναφορικά με το κοινό ανακοινωθέν Τσίπρα - Ιερώνυμου περί διαχωρισμού Κράτους και Εκκλησίας. Σε συνέντευξή του στο Ράδιο Κρήτη και στον Μανώλη Αργυράκη, ο Αρχιεπίσκοπος Κρήτης κ. Ειρηναίος, τόνισε ότι η Ιερά Επαρχιακή Σύνοδος της Εκκλησίας της Κρήτης, συνεδρίασε τη Δευτέρα και την Τρίτη, με διάφορα θέματα, ωστόσο ο διαχωρισμός Κράτους - Εκκλησίας, δεν ήταν ένα από αυτά.
Κληθείς να σχολιάσεις τις εξελίξεις, ο Αρχιεπίσκοπος Κρήτης τόνισε: "Κράτος και Εκκλησία είμαστε ένα. Είμαστε ένας λαός. Αυτό θα πει Ελλάδα, όχι να χωριζόμαστε στα δύο. Δεν θέλουμε τον διχασμό. Η ιστορία μας η παράδοσή μας αυτό μας έχει διδάξει".
